Los estudios y las actividades que desarrolla el IEP se realizan gracias al apoyo de diversas fuentes de financiamiento, entre las que se encuentran fundaciones privadas dedicadas a la investigación y el desarrollo, embajadas y organismos de cooperación internacional, así como instituciones peruanas públicas y privadas. Además, las diversas consultorías que realizan nuestros miembros asociados con organismos e instituciones de diversas partes del mundo, le proporcionan al Instituto fondos adicionales que le permiten avanzar hacia sus objetivos. De otro lado, la intensa labor editorial del IEP también brinda recursos que posibilitan la realización de las actividades de su Fondo Editorial.
Entre las organizaciones e instituciones que han apoyado al IEP a lo largo de sus más de 50 años de vida se encuentran las siguientes:
NACIONALES
- Asociación Ecología, Tecnología y Cultura en los Andes – ETC Andes
- CARE Perú
- Consorcio de Investigación Económica y Social – CIES
- Derrama Magisterial
- Fundación BBVA
- Fundación Telefónica
- Grupo de Análisis para el Desarrollo – GRADE
- Innovación y Competitividad para el Agro Peruano – INCAGRO
- NESsT Perú
- Organización Intereclesiástica para Cooperación al Desarrollo – ICCO
- Pontificia Universidad Católica del Perú – PUCP
- Red para el Desarrollo de las Ciencias Sociales en el Perú
INTERNACIONALES
- Academy for Educational Development – AED
- Agencia Canadiense para el Desarrollo Internacional ACDI
- Agencia de los Estados Unidos para el Desarrollo – USAID
- Agencia Suiza para el Desarrollo y la Cooperación – COSUDE
- Banco Interamericano de Desarrollo – BID
- Banco Mundial
- Center for Integrated Area Studies, Kyoto University – CIAS
- Centro Latinoamericano para el Desarrollo Rural – RIMISP
- Citi Foundation
- Consejo Latinoamericano de Ciencias Sociales – CLACSO
- Cooperación Alemana para el Desarrollo – GIZ
- Corporación Financiera Internacional – IFC
- Department for International Development – DFID
- Embajada Británica, Facultad Latinoamericana de Ciencias Sociales – FLACSO
- Fondo de las Naciones Unidas para la Infancia – UNICEF
- Fondo de Población de las Naciones Unidas – UNFPA
- Fondo Internacional de Desarrollo Agrícola – FIDA
- Fondo Ítalo Peruano, Fundación Bernard Van Leer
- Fundación Carolina, Fundación Equitas
- Fundación Ford, Fundación Rockefeller
- Institute for Development Studies (IDS)
- Instituto Francés de Estudios Andinos – IFEA
- International Development Research Centre – IDRC
- Japan Center for Area Studies – JCAS
- Japan External Trade Organization – JETRO
- Observatorio Latinoamérica de Desigualdad – Universidad de Miami
- Open Society Institute – OSI
- Organización de Estados Iberoamericanos para la Educación – OEI
- Organización de las Naciones Unidas para la Alimentación y la Agricultura – FAO
- Organización de las Naciones Unidas para la Educación, la Ciencia y la Cultura – UNESCO
- Organización Internacional del Trabajo – OIT
- Oxfam América
- Programa de las Naciones Unidas para el Desarrollo – PNUD
- Save the Children
- South-South Exchange Programme for Research on the History of Development – SEPHIS, Singapore Internet Research Centre – SiRC
- The Learning Initiative on Citizen Participation and Local Governance – LogoLink
- The Tinker Foundation
- Universidad de Harvard, Universidad de Vanderbilt
- Universidad de Wisconsin–Madison
- Universitat Oberta de Catalunya