El máximo órgano de dirección del IEP es su Asamblea de Asociados, que en la actualidad cuenta con 47 integrantes. Cada dos años, dicha Asamblea elige a un Director o Directora General y a un Consejo Directivo que dirige el funcionamiento del Instituto.
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Carlos Contreras Carranza
Historiador - Pontificia Universidad Católica del Perú
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Romeo Grompone Grille
Sociólogo - Universidad de la República - Uruguay
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Marcos Cueto Caballero
Historiador - Pontificia Universidad Católica del Perú
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Julio Carrión
Sociólogo - Universidad Nacional Mayor de San Marcos
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Cecilia Blondet Montero
Historiadora - Pontificia Universidad Católica del Perú
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Teobaldo Pinzás
Economista - Pontificia Universidad Católica del Perú
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Carmen Montero Checa
Socióloga - Pontificia Universidad Católica del Perú
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Oscar Castillo Rivadeneyra
Sociólogo - Universidad Nacional Pedro Ruíz Gallo
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Efraín Gonzales de Olarte
Economista - Universidad Nacional de San Antonio Abad
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Gastón Antonio Zapata Velasco
Historiador - Pontificia Universidad Católica del Perú
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Martín Tanaka
Sociólogo - Pontificia Universidad Católica del Perú
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Patricia Oliart
Socióloga - Pontificia Universidad Católica del Perú
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Jorge Bracamonte Allaín
Historiador - Universidad Nacional Mayor de San Marcos
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Victor Vich
Crítico literario - Pontificia Universidad Católica del Perú
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Patricia Zárate Ardela
Socióloga - Pontificia Universidad Católica del Perú
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Pablo Sandoval López
Antropólogo - Universidad Nacional Mayor de San Marcos
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Giovanna Aguilar Andía
Economista - Pontificia Universidad Católica del Perú
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Natalia González Carrasco
Historiadora - Universidad Nacional San Cristóbal de Huamanga
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Ramón Pajuelo Tevez
Antropólogo - Universidad Nacional Mayor de San Marcos
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Hildegardi Venero Farfán
Economista - Universidad Nacional San Antonio Abad del Cusco
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Raúl Asensio
Historiador - Universidad de Cádiz
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Mariana Eguren Arce
Lingüista - Pontificia Universidad Católica del Perú
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Rolando Rojas Rojas
Historiador - Universidad Nacional Mayor de San Marcos
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Juan José Miranda
Economista - Universidad del Pacífico
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Carlos De los Ríos Farfán
Economista - Universidad del Pacífico
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Tania Vásquez Luque
Socióloga - Pontificia Universidad Católica del Perú
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Peter Busse Cárdenas
Comunicador - Pontificia Universidad Católica del Perú
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Johanna Yancari Cueva
Economista - Pontificia Universidad Católica del Perú
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Jorge Aragón Trelles
Politólogo - Pontificia Universidad Católica del Perú
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Carmen Yon
Socióloga - Pontificia Universidad Católica del Perú
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Jorge Morel
Politólogo - Pontificia Universidad Católica del Perú
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Francesca Uccelli Labarthe
Antropóloga - Pontificia Universidad Católica del Perú
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Aileen Agüero García
Economista - Universidad Católica del Perú
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Úrsula Aldana
Economista - Pontificia Universidad Católica del Perú
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María Luisa Burneo de la Rocha
Antropóloga - Pontificia Universidad Católica del Perú
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Sandra Carrillo Luna
Psicóloga Educacional - Pontificia Universidad Católica del Perú
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Jaime Ramos Duffaut
Educador - Pontificia Universidad Católica del Perú
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Marcos Garfias Dávila
Historiador - Universidad Nacional Mayor de San Marcos
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Jaime Urrutia Ceruti
Historiador - Universidad Nacional San Cristóbal de Huamanga
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Ricardo Cuenca Pareja
Psicólogo social - Universidad Autónoma de Madrid
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María Isabel Remy Simatovic
Socióloga - Pontificia Universidad Católica del Perú
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Dynnik Asencios Lindo
Antropólogo - Universidad Nacional Mayor de San Marcos
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Alvaro Gálvez Pasco
Politólogo - London School of Economics and Political Science
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Paolo Sosa Villagarcia
Politólogo - Pontificia Universidad Católica del Perú
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Carolina Trivelli Ávila
Economista - Pontificia Universidad Católica del Perú
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Carolina de Belaunde de Cárdenas
Historiadora - Pontificia Universidad Católica del Perú
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Rodrigo Gil Piedra
Politólogo - Pontificia Universidad Católica del Perú
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Patricia Ames Ramello
Antropóloga - Pontificia Universidad Católica del Perú
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Luis Miguel Glave Testino
Historiador - Centro Bartolomé de las Casas