En este programa institucional se aborda el proceso de transición democrática y la descentralización, principal reforma emprendida en este periodo. Las investigaciones analizan el desempeño del Estado en su implementación, así como los riesgos y limitaciones del proceso. El programa vinculó al IEP con instituciones de otras regiones, con las cuales se realizaron investigaciones conjuntas. Entre las principales, están el CIPCA de Piura, el CBC del Cusco, el CEDISA de San Martin y el IPAZ de Ayacucho. Además, se realizaron las dos primeras encuestas institucionales en las que se recogieron las percepciones de la población sobre la descentralización.

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