El trabajo de investigación del IEP se caracteriza por dar cuenta de los principales problemas y desafíos de la sociedad peruana. Más allá de abordar un tema en particular, lo que busca es comprender al Perú como un todo en relación a los países de la región. El equipo de investigadores es plural, mantiene un intenso diálogo interdisciplinario y está en permanente renovación generacional. Todas las actividades de investigación se organizan en torno a cuatro ejes: Estado, política y democracia; desarrollo, desigualdades y sostenibilidad; sociedad, territorio y migraciones; historia, cultura y diversidad.

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